一是管理方面。集中式饮用水水源保护区的划定，由区人民政府提出划定方案，由市人民政府批准；分散式饮用水源地按照规定提出划定保护范围的方案，区人民政府批准，并报市环境保护主管部门备案。二是划分的区域。集中式饮用水源地划分一级保护区、二级保护区，必要时划分准保护区；分散式饮用水源地划定保护范围。三是管理主体责任不同。集中式饮用水源地是区人民政府统一监管，分散式饮用水源地由镇乡人民政府监督管理。